В старшей школе Огава, где футбол считается исключительно мужским видом спорта, женская команда существует лишь номинально. Её костяк — несколько девчонок, которые гоняют мяч скорее по привычке, чем из амбиций. Тренер, пожилой мужчина, давно махнул на них рукой, а одноклассники откровенно посмеиваются. Всё меняется с приходом Ноацуми — тихой и замкнутой новенькой, которая на деле оказывается бывшей восходящей звездой юношеского футбола. Два года назад она бросила спорт после травмы и психологического давления со стороны тренеров-мужчин, которые не верили в девочку-футболистку. Ноацуми не хочет играть, но её вынуждает обстоятельство: в школе действует правило, что для сохранения клуба нужно набрать минимум одиннадцать игроков. Вместе с ней в команду вступают ещё несколько случайных людей — от отчаянной одиночки Ватанабэ, которая ищет в футболе способ выплеснуть агрессию, до тихони Танаки, впервые в жизни решившейся на что-то «неженское».
Постепенно из разрозненных аутсайдеров девчонки превращаются в настоящую команду, но путь к первому же турниру оказывается усеян не только спортивными трудностями. Им приходится сталкиваться с открытым сексизмом судей, с насмешками соперников-парней и с собственными семьями, которые не понимают, зачем дочерям «пачкаться на поле». Ноацуми, скрепя сердце, начинает тренировать девчонок, передавая им не только технику, но и ту самую жестокую любовь к игре, которую когда-то в ней убили. Кульминацией становится товарищеский матч против мужской сборной школы — грубой, самоуверенной команды, которая обещает «сделать из девчонок отбивные». В этом матче, проигранном по счёту, но выигранном по духу, каждая из героинь находит свой голос. Ватанабэ впервые не бьёт соперника в ответ на грубость, а обыгрывает его финтом. Танака забивает свой первый гол. А Ноацуми, вспомнив, за что она полюбила футбол, отдаёт голевую передачу и улыбается. «Прощай, мой дорогой Крамер» — это не история о громких победах и кубках. Это горький и светлый рассказ о том, как девчонки, которым общество сказало «ты не сможешь», доказывают, что футбол не имеет пола, и о том, что иногда, чтобы найти себя, нужно сначала потерять всё, включая собственную мечту.